Die Seen liegen im Leinegraben in einer rund 2 km breiten Talsohle bei ca. 110 m üNN zumeist rechts und auch links entlang der Leine. In dieser Gegend stehen unter der Bodenschicht ca. 50 m pleistozäne Kiese an. Durch den Zufluss der Rhume liegt der Leinegraben hier im Schüttungsbereich des Harzes,